
這種疫苗的原理是利用腺病毒第五型來表現愛滋病毒的蛋白Gag,Gag蛋白是愛滋病毒的內部蛋白之一,主要功用是構成病毒體的外殼; 在外殼之外,還有一層套膜跟一些醣蛋白組合起來的構造,其中包括很有名的gp120,gp120就是愛滋病毒用來跟T細胞上的CD4接觸,進而感染這些T細胞的最主要蛋白。然而因為愛滋病毒是RNA病毒,很容易造成這些表面蛋白如gp120的變異,所以即便人體發展出對抗gp120的抗體,很快的愛滋病毒又會突變出其他的gp120,讓抗體無法辨識,所以疫苗學家轉而研究其他便異性比較低的蛋白,Gag就是其中一種。
2009年的美國國家科學院院刊裡的一篇文章闡述了這種疫苗失敗的原因之一:英國的研究人員Steven Patterson等認為這種疫苗所利用的載體病毒--腺病毒第五型,會活化體內的T細胞,並且會使得這些活化後的T細胞聚集到生殖道附近,反而更容易讓愛滋病毒感染這些T細胞。